Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ncapd3Q6ZQK0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms