Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Topbp1Q6ZQF0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms