Protein–RNA interactions for Protein: Q6X1Y6

Asic3, Acid-sensing ion channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic3Q6X1Y6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Asic3Q6X1Y6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Asic3Q6X1Y6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Asic3Q6X1Y6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Asic3Q6X1Y6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Asic3Q6X1Y6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Asic3Q6X1Y6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Asic3Q6X1Y6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Asic3Q6X1Y6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Asic3Q6X1Y6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms