Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cxcl3Q6W5C0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl3Q6W5C0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms