Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Timd4Q6U7R4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms