Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nudcd1Q6PIP5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nudcd1Q6PIP5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms