Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc82Q6PG04 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms