Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gramd2bQ6PEM6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms