Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Taf1cQ6PDZ2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms