Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trak1Q6PD31 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trak1Q6PD31 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms