Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6PD19 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6PD19 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6PD19 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6PD19 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6PD19 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6PD19 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6PD19 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6PD19 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6PD19 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6PD19 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6PD19 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6PD19 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6PD19 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6PD19 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6PD19 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6PD19 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6PD19 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6PD19 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6PD19 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6PD19 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6PD19 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6PD19 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6PD19 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Q6PD19 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6PD19 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6PD19 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6PD19 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6PD19 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6PD19 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6PD19 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6PD19 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6PD19 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6PD19 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6PD19 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6PD19 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6PD19 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6PD19 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6PD19 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6PD19 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6PD19 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6PD19 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6PD19 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6PD19 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6PD19 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Q6PD19 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6PD19 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6PD19 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6PD19 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6PD19 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6PD19 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6PD19 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6PD19 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6PD19 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6PD19 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6PD19 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6PD19 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6PD19 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6PD19 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6PD19 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6PD19 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6PD19 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6PD19 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6PD19 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6PD19 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6PD19 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6PD19 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6PD19 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6PD19 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6PD19 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6PD19 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6PD19 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6PD19 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6PD19 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Q6PD19 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6PD19 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6PD19 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6PD19 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6PD19 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6PD19 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6PD19 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6PD19 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6PD19 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6PD19 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6PD19 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6PD19 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6PD19 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6PD19 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6PD19 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6PD19 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6PD19 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q6PD19 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6PD19 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6PD19 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6PD19 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6PD19 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6PD19 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6PD19 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6PD19 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Q6PD19 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms