Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5G6

Ubxn7, UBX domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn7Q6P5G6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn7Q6P5G6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn7Q6P5G6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn7Q6P5G6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn7Q6P5G6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn7Q6P5G6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn7Q6P5G6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn7Q6P5G6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn7Q6P5G6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms