Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T2

Snrnp200, U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp200Q6P4T2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp200Q6P4T2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms