Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Hdac4Q6NZM9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdac4Q6NZM9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdac4Q6NZM9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdac4Q6NZM9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdac4Q6NZM9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdac4Q6NZM9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdac4Q6NZM9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdac4Q6NZM9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdac4Q6NZM9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdac4Q6NZM9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdac4Q6NZM9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdac4Q6NZM9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdac4Q6NZM9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdac4Q6NZM9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdac4Q6NZM9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdac4Q6NZM9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdac4Q6NZM9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdac4Q6NZM9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdac4Q6NZM9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdac4Q6NZM9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdac4Q6NZM9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdac4Q6NZM9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdac4Q6NZM9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdac4Q6NZM9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Hdac4Q6NZM9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms