Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Fndc3bQ6NWW9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms