Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HelbQ6NVF4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HelbQ6NVF4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms