Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Wdr44Q6NVE8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms