Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp140Q6NSQ5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp140Q6NSQ5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp140Q6NSQ5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp140Q6NSQ5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp140Q6NSQ5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp140Q6NSQ5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp140Q6NSQ5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp140Q6NSQ5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp140Q6NSQ5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp140Q6NSQ5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sp140Q6NSQ5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sp140Q6NSQ5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms