Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Carmil1Q6EDY6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Carmil1Q6EDY6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms