Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Smarca2Q6DIC0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms