Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rftn1Q6A0D4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rftn1Q6A0D4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms