Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdzrn3Q69ZS0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdzrn3Q69ZS0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdzrn3Q69ZS0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdzrn3Q69ZS0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdzrn3Q69ZS0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdzrn3Q69ZS0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pdzrn3Q69ZS0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pdzrn3Q69ZS0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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