Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd1cQ69ZK6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd1cQ69ZK6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd1cQ69ZK6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd1cQ69ZK6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd1cQ69ZK6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd1cQ69ZK6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd1cQ69ZK6 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd1cQ69ZK6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd1cQ69ZK6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd1cQ69ZK6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd1cQ69ZK6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd1cQ69ZK6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd1cQ69ZK6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd1cQ69ZK6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd1cQ69ZK6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd1cQ69ZK6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd1cQ69ZK6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jmjd1cQ69ZK6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms