Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk13Q69ZA1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk13Q69ZA1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk13Q69ZA1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk13Q69ZA1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk13Q69ZA1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk13Q69ZA1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk13Q69ZA1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms