Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nlrp4eQ66X19 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nlrp4eQ66X19 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nlrp4eQ66X19 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nlrp4eQ66X19 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nlrp4eQ66X19 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp4eQ66X19 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp4eQ66X19 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp4eQ66X19 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp4eQ66X19 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp4eQ66X19 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp4eQ66X19 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp4eQ66X19 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp4eQ66X19 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp4eQ66X19 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp4eQ66X19 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp4eQ66X19 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp4eQ66X19 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp4eQ66X19 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp4eQ66X19 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nlrp4eQ66X19 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp4eQ66X19 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp4eQ66X19 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp4eQ66X19 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nlrp4eQ66X19 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms