Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms