Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Sall3Q62255 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sall3Q62255 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms