Protein–RNA interactions for Protein: Q62231

Six1, Homeobox protein SIX1, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six1Q62231 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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Six1Q62231 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Six1Q62231 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Six1Q62231 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Six1Q62231 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Six1Q62231 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Six1Q62231 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Six1Q62231 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Six1Q62231 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Six1Q62231 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Six1Q62231 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Six1Q62231 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Six1Q62231 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Six1Q62231 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Six1Q62231 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Six1Q62231 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Six1Q62231 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Six1Q62231 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Six1Q62231 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Six1Q62231 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Six1Q62231 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Six1Q62231 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Six1Q62231 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Six1Q62231 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Six1Q62231 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Six1Q62231 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Six1Q62231 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Six1Q62231 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Six1Q62231 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Six1Q62231 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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