Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Odf1Q61999 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Odf1Q61999 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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