Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
AtrxQ61687 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrxQ61687 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms