Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itm2aQ61500 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itm2aQ61500 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms