Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd53Q61451 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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