Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxd1Q61345 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxd1Q61345 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxd1Q61345 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxd1Q61345 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Foxd1Q61345 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Foxd1Q61345 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Foxd1Q61345 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Foxd1Q61345 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Foxd1Q61345 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Foxd1Q61345 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Foxd1Q61345 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
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Foxd1Q61345 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Foxd1Q61345 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Foxd1Q61345 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Foxd1Q61345 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms