Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbbp4Q60972 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbbp4Q60972 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms