Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkn2dQ60773 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms