Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Epha1Q60750 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms