Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc1Q60596 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Xrcc1Q60596 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Xrcc1Q60596 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Xrcc1Q60596 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc1Q60596 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc1Q60596 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc1Q60596 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc1Q60596 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc1Q60596 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc1Q60596 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc1Q60596 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc1Q60596 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc1Q60596 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms