Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sin3aQ60520 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sin3aQ60520 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms