Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tdrd5Q5VCS6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tdrd5Q5VCS6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms