Protein–RNA interactions for Protein: Q5U901

Cpa6, Carboxypeptidase A6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa6Q5U901 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpa6Q5U901 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms