Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ankrd40Q5SUE8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd40Q5SUE8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms