Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sft2d1Q5SSN7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sft2d1Q5SSN7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms