Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mdc1Q5PSV9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms