Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC83

Spata48, Spermatogenesis-associated protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata48Q5NC83 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spata48Q5NC83 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms