Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Nlrc3Q5DU56 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Nlrc3Q5DU56 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Nlrc3Q5DU56 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Nlrc3Q5DU56 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Nlrc3Q5DU56 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Nlrc3Q5DU56 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Nlrc3Q5DU56 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Nlrc3Q5DU56 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Nlrc3Q5DU56 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Nlrc3Q5DU56 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nlrc3Q5DU56 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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