Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrc8bQ5DU41 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc8bQ5DU41 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms