Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ndufaf2Q59J78 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ndufaf2Q59J78 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms