Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrig2Q52KR2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms