Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otol1Q4ZJM7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otol1Q4ZJM7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms