Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc27a5Q4LDG0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms